สำนักตรวจเงินแผ่นดินจังหวัดกระบี่ สังกัดสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดินภูมิภาคที่ ๑๔ (จังหวัดนครศรีธรรมราช) เดิมตั้งอยู่ที่สำนักงานการตรวจเงินแผ่นดินภูมิภาคที่ ๑๔ (จังหวัดนครศรีธรรมราช) เนื่องจากสำนักงานการตรวจเงินแผ่นดินภูมิภาคและสำนักตรวจเงินแผ่นดินจังหวัดในกำกับดูแลปฏิบัติราชการอยู่ในที่ตั้งเดียวกัน และได้มีการย้ายที่ตั้งมาประจำอยู่ที่จังหวัดกระบี่เมื่อวันที่ 14 กุมภาพันธ์ 2555 ตั้งอยู่ที่ อาคารวิทยบริการ ชั้น 3 วิทยาลัยพลศึกษาวิทยาเขตกระบี่ ถนนศรีตรัง อำเภอเมืองกระบี่ จังหวัดกระบี่ และย้ายมาประจำอยู่ที่ทำการปัจจุบันคือ อาคารหลังศาลากลางเก่าชั้น ๒ ถนนอุตรกิจ ตำบลปากน้ำ อำเภอเมืองกระบี่ จังหวัดกระบี่ เมื่อวันที่ 27 กุมภาพันธ์ 2558